培养箱必须先经过清洁才能实现消毒和灭菌的目的，许多杀菌剂只对经过清洁过的物品才具有杀菌活性。清洁时必须使用与以后使用的消毒剂或杀菌剂化学性质上相容的试剂进行清洁、消毒。

　?、偾褰嘞涮灞砻妫合确魅ケ砻娴幕页?，再用湿的海绵或软布清洗，再用软布擦干。如果有污物则用低浓度的清洁剂清洗，然后擦干。

　?、谇逑聪涮迥诓浚貉≡窈鲜实南炯痢Ｋ械奈锛捅砻姹匦肭逑?，然后用无菌水冲洗，再擦干或晾干。

　?、矍逑床Ａ牛呵逑聪淠诘牟Ａ攀笔褂玫那褰嗉梁颓逑磁嘌淠诓渴笔褂玫南嗤Ｈ缓笥谜袅笏?，从而清除残留的清洁剂，最后用软布把门擦干。

　　二氧化碳培养箱的消毒和灭菌

　　消毒是指杀死微生物的物理或化学手段，但不一定杀死其孢子。灭菌是指杀死所有微生物，当培养箱内细胞受到污染时则需要采取灭菌措施。一般，在培养箱内细胞没有污染的情况下平均1-3个月消毒一次。的3种消毒灭菌的方式是：液体消毒剂、紫外和加热。

　?、僖禾逑炯粒貉≡穸耘嘌湮薷葱缘囊禾逑炯粒⑶乙禾逑炯恋南拘Ч没岛秃芏嘁蛩赜泄?。比如：场所的温度、接触时间、pH、穿透能力、有机物的反应。这些因素中的一些很小的变化可能会造成去污剂的效力上大的不同。因此甚至在很有利的情况下，当最终要求必须无菌时，液体去污剂也不是可信赖的去污方法。

　?、谧贤庀荆阂话阆扔谜袅笏逑锤删缓?，再用培养箱自带的紫外灯照射一天或者用手提式的紫外灯照射。因被遮挡时或距离远时都会削弱紫外灭菌的效果，紫外灭菌方式较为简单。

　　③加热：湿热和干热被认为是杀菌的方法。在一般环境下，高压灭菌器加热到121℃快速产生蒸汽是的方法，但是二氧化碳培养箱无法进行高温高压灭菌，只能退而求其次进行90℃湿热灭菌，但90℃因为温度过低，起不到100℃以上水蒸汽所带来的渗透性和高压力效果，所以灭菌效果也大打折扣.而干热140℃-180℃，可以起到灭菌的作用。